38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0727 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_0727  hypothetical protein  100 
 
 
76 aa  155  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  42.03 
 
 
152 aa  56.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  40.58 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  40.58 
 
 
152 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  42.11 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  42.47 
 
 
153 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  40 
 
 
136 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  41.77 
 
 
153 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  40.28 
 
 
153 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  44.74 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  44.74 
 
 
166 aa  48.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  36.84 
 
 
153 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  40.54 
 
 
157 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  46.15 
 
 
152 aa  47  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  41.79 
 
 
164 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  41.89 
 
 
159 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  39.44 
 
 
150 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  47.17 
 
 
157 aa  46.2  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  40.28 
 
 
149 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  42.11 
 
 
166 aa  46.2  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  32.43 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  36.99 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  34.78 
 
 
159 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  34.78 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  36.23 
 
 
158 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  36.23 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  36.23 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  33.78 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  36.23 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  37.68 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  33.33 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  34.67 
 
 
162 aa  41.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  37.93 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  41.67 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  40.28 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  36 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  39.24 
 
 
153 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>