73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_21800 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  290  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  74.31 
 
 
145 aa  213  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  72.22 
 
 
145 aa  211  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  72.22 
 
 
145 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  50.34 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  50.34 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  50.34 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  48.98 
 
 
159 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  48.65 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  48.3 
 
 
159 aa  135  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  48.3 
 
 
158 aa  134  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  47.62 
 
 
159 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  45.95 
 
 
149 aa  128  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  37.33 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  38.96 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  39.22 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  36.36 
 
 
152 aa  84.3  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  40.26 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  38.31 
 
 
153 aa  84  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  35.48 
 
 
159 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  38.82 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  38.24 
 
 
156 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  37.42 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  36.77 
 
 
157 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  35.88 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  38.06 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  35.95 
 
 
152 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  37.41 
 
 
157 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  34.71 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  34.71 
 
 
166 aa  74.3  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  38.96 
 
 
153 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  36.03 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  38.03 
 
 
157 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  37.78 
 
 
155 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  36.18 
 
 
151 aa  73.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  32.61 
 
 
154 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  38.13 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  36.3 
 
 
156 aa  72.4  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  31.34 
 
 
136 aa  72  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  33.97 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  38.52 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  32.26 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  32.89 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  34.21 
 
 
155 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  32.69 
 
 
156 aa  70.1  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  33.12 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  39.66 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  34.59 
 
 
158 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  39.17 
 
 
151 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  35 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  34.38 
 
 
157 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  30.3 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  29.55 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  36.17 
 
 
157 aa  58.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  33.81 
 
 
158 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  34.97 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  29.41 
 
 
150 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  28.03 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  30.46 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  29.85 
 
 
160 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  37.93 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  34.31 
 
 
176 aa  53.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  33.05 
 
 
160 aa  53.5  0.0000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  34.35 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  27.34 
 
 
162 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  25 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4771  RES domain-containing protein  32.19 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3122  hypothetical protein  28.08 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0727  hypothetical protein  33.78 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  31.53 
 
 
117 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  30.88 
 
 
168 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>