59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0494 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  238  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  52.73 
 
 		 159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  50.91 
 
 		 161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  50.94 
 
 		 165 aa  104  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  45.05 
 
 		 156 aa  91.3  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  35.29 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  35.29 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  53.45 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  39.56 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  35.48 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  35.19 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  34.45 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  33.91 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  37.84 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  54.72 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  40 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  30.91 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  37.07 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  31.93 
 
 		 166 aa  51.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  42.86 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  37.07 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  37.07 
 
 		 159 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  32.76 
 
 		 166 aa  50.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  33.64 
 
 		 153 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  35.34 
 
 		 158 aa  50.8  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  32.76 
 
 		 166 aa  50.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  45.59 
 
 		 155 aa  50.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  34.25 
 
 		 159 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  31.86 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  35.34 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  33.62 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  36.19 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  47.83 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  33.02 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  35.19 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  44.83 
 
 		 176 aa  47.4  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  34.26 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  34.26 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  33.04 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  49.09 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  32.73 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  32.17 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  44.44 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  35.42 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  27.93 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  35.35 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  58.33 
 
 		 157 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  53.66 
 
 		 151 aa  43.9  0.0008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  42.65 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  28.41 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  27.97 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  31.53 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  46.15 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  34.15 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  35.16 
 
 		 136 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  29.46 
 
 		 153 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  22.64 
 
 		 156 aa  40  0.01  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>