24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4546 on replicon NC_008243
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  82.32 
 
 		 168 aa  286  8e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  73.78 
 
 		 165 aa  256  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  64.2 
 
 		 173 aa  225  3e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  39.31 
 
 		 172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  37.97 
 
 		 178 aa  110  8.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  38.18 
 
 		 181 aa  93.2  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  35 
 
 		 166 aa  90.1  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  33.13 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  36.36 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  33.12 
 
 		 159 aa  51.2  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  50.7 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  44.26 
 
 		 157 aa  50.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  51.06 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  48.94 
 
 		 158 aa  48.1  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  38.46 
 
 		 154 aa  47.8  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  31.58 
 
 		 155 aa  45.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  43.75 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  26.9 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  33.57 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  38.96 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  34.15 
 
 		 117 aa  41.2  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  33.14 
 
 		 174 aa  40.8  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>