15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1442 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  100 
 
 
181 aa  372  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  56.5 
 
 
178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  45.03 
 
 
172 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  37.06 
 
 
168 aa  114  8.999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  36.2 
 
 
173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  38.18 
 
 
180 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  37.13 
 
 
165 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  39.63 
 
 
159 aa  98.2  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  36.14 
 
 
166 aa  89.4  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  36.36 
 
 
174 aa  84.3  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  38.69 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  37.35 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  33.12 
 
 
178 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  42.59 
 
 
150 aa  41.6  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  28.28 
 
 
154 aa  41.2  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>