15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9507 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  353  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  75.86 
 
 		 174 aa  274  5e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  167  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  50.3 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  43.71 
 
 		 178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  44.38 
 
 		 174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  38.01 
 
 		 178 aa  95.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  35.4 
 
 		 166 aa  90.9  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  38.95 
 
 		 172 aa  81.3  0.000000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  37.35 
 
 		 181 aa  79.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  33.57 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  30.72 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  32.24 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  29.94 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  30.56 
 
 		 343 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>