16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2256 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  100 
 
 
343 aa  704    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0537  hypothetical protein, putative phage gene  33.76 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.264448  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4795  RES domain-containing protein  24.4 
 
 
372 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1895  RES domain protein  27.35 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.655067  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3755  hypothetical protein  24.65 
 
 
477 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1039  RES domain-containing protein  26.42 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.626562  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3793  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1984  hypothetical protein  22.86 
 
 
403 aa  59.3  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1928  RES domain protein  30.29 
 
 
414 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0352556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1974  hypothetical protein  23.46 
 
 
489 aa  56.6  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387676  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2225  RES domain-containing protein  22.38 
 
 
619 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4333  RES domain-containing protein  25.99 
 
 
481 aa  55.8  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2135  RES domain protein  22.66 
 
 
413 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  30.83 
 
 
159 aa  47  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2097  hypothetical protein  32.1 
 
 
264 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5210  hypothetical protein  35.71 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>