11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1928 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1928  RES domain protein  100 
 
 		 414 aa  856    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0352556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3793  hypothetical protein  34.65 
 
 		 379 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0537  hypothetical protein, putative phage gene  27.62 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.264448  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1039  RES domain-containing protein  33.51 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.626562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1974  hypothetical protein  27.69 
 
 		 489 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4333  RES domain-containing protein  33.57 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  30.29 
 
 		 343 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1895  RES domain protein  23.47 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.655067  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3755  hypothetical protein  28.8 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4795  RES domain-containing protein  27.12 
 
 		 372 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1984  hypothetical protein  29.2 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>