12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3793 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3793  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  780    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1928  RES domain protein  34.65 
 
 		 414 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0352556  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1974  hypothetical protein  25.52 
 
 		 489 aa  86.3  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1039  RES domain-containing protein  33.71 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.626562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4333  RES domain-containing protein  34.29 
 
 		 481 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0537  hypothetical protein, putative phage gene  28.36 
 
 		 237 aa  77.4  0.0000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.264448  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3755  hypothetical protein  25.92 
 
 		 477 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4795  RES domain-containing protein  24.26 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1895  RES domain protein  28.74 
 
 		 268 aa  73.9  0.000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.655067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1984  hypothetical protein  21.46 
 
 		 403 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  24.93 
 
 		 343 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4896  RES domain protein  20.96 
 
 		 392 aa  49.7  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>