18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1039 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1039  RES domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.626562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1974  hypothetical protein  50 
 
 		 489 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4333  RES domain-containing protein  51.03 
 
 		 481 aa  268  8.999999999999999e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3755  hypothetical protein  41.94 
 
 		 477 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1984  hypothetical protein  33.72 
 
 		 403 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3793  hypothetical protein  33.71 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4795  RES domain-containing protein  35.53 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2135  RES domain protein  30.24 
 
 		 413 aa  76.6  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4896  RES domain protein  33.69 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0537  hypothetical protein, putative phage gene  31.47 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.264448  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  26.42 
 
 		 343 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2225  RES domain-containing protein  32.89 
 
 		 619 aa  64.3  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1928  RES domain protein  33.51 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0352556  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1895  RES domain protein  24.29 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.655067  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6334  hypothetical protein  23.94 
 
 		 191 aa  49.7  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5210  hypothetical protein  29.01 
 
 		 303 aa  49.7  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2097  hypothetical protein  26.35 
 
 		 264 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0969  hypothetical protein  23.4 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>