14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1974 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1974  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  1013    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4333  RES domain-containing protein  50.1 
 
 		 481 aa  425  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1039  RES domain-containing protein  50 
 
 		 319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.626562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3755  hypothetical protein  33.51 
 
 		 477 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4795  RES domain-containing protein  27.42 
 
 		 372 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1984  hypothetical protein  25.26 
 
 		 403 aa  92.8  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2135  RES domain protein  25 
 
 		 413 aa  88.6  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3793  hypothetical protein  25.52 
 
 		 379 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4896  RES domain protein  26.41 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0537  hypothetical protein, putative phage gene  27.15 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.264448  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1928  RES domain protein  27.69 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0352556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  23.46 
 
 		 343 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1895  RES domain protein  25.1 
 
 		 268 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.655067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2225  RES domain-containing protein  26.03 
 
 		 619 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  0.94728 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>