10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2135 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2135  RES domain protein  100 
 
 		 413 aa  863    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2225  RES domain-containing protein  34.25 
 
 		 619 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4795  RES domain-containing protein  34.55 
 
 		 372 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4896  RES domain protein  31.2 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1974  hypothetical protein  25 
 
 		 489 aa  88.6  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387676  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3755  hypothetical protein  24.19 
 
 		 477 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1039  RES domain-containing protein  30.24 
 
 		 319 aa  76.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.626562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4333  RES domain-containing protein  31.25 
 
 		 481 aa  74.3  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1984  hypothetical protein  27 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  22.66 
 
 		 343 aa  52.4  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>