13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4795 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4795  RES domain-containing protein  100 
 
 		 372 aa  768    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2135  RES domain protein  34.55 
 
 		 413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2225  RES domain-containing protein  33.06 
 
 		 619 aa  168  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4896  RES domain protein  33.33 
 
 		 392 aa  149  8e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3755  hypothetical protein  29.6 
 
 		 477 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1974  hypothetical protein  27.42 
 
 		 489 aa  98.2  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4333  RES domain-containing protein  24.37 
 
 		 481 aa  90.1  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1039  RES domain-containing protein  35.53 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.626562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3793  hypothetical protein  24.26 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  24.4 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1984  hypothetical protein  22.71 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0537  hypothetical protein, putative phage gene  25.83 
 
 		 237 aa  53.1  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.264448  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1895  RES domain protein  23.91 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.655067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>