15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4333 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4333  RES domain-containing protein  100 
 
 		 481 aa  994    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1974  hypothetical protein  50.1 
 
 		 489 aa  438  1e-121  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1039  RES domain-containing protein  51.03 
 
 		 319 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.626562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3755  hypothetical protein  32.38 
 
 		 477 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1984  hypothetical protein  25.23 
 
 		 403 aa  100  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4795  RES domain-containing protein  25.51 
 
 		 372 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3793  hypothetical protein  34.29 
 
 		 379 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2135  RES domain protein  31.25 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0537  hypothetical protein, putative phage gene  30.25 
 
 		 237 aa  65.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.264448  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4896  RES domain protein  31.18 
 
 		 392 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1895  RES domain protein  22.5 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.655067  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2225  RES domain-containing protein  28.82 
 
 		 619 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1928  RES domain protein  34.29 
 
 		 414 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0352556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  25.99 
 
 		 343 aa  55.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2097  hypothetical protein  24.54 
 
 		 264 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>