13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2225 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2225  RES domain-containing protein  100 
 
 
619 aa  1260    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2775  hypothetical protein  55.61 
 
 
202 aa  189  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2135  RES domain protein  33.87 
 
 
413 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4795  RES domain-containing protein  32.79 
 
 
372 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5181  hypothetical protein  45.9 
 
 
231 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0758105  normal 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4896  RES domain protein  29.09 
 
 
392 aa  136  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3755  hypothetical protein  25.73 
 
 
477 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4333  RES domain-containing protein  26.73 
 
 
481 aa  64.3  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1039  RES domain-containing protein  33.55 
 
 
319 aa  64.3  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.626562  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  22.38 
 
 
343 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1984  hypothetical protein  26.34 
 
 
403 aa  52.8  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1974  hypothetical protein  26.4 
 
 
489 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387676  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4577  hypothetical protein  30 
 
 
173 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.521673  normal  0.0977602 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>