14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3755 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3755  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  971    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.271307  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1974  hypothetical protein  33.51 
 
 		 489 aa  190  5e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.387676  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4333  RES domain-containing protein  32.38 
 
 		 481 aa  165  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1039  RES domain-containing protein  41.94 
 
 		 319 aa  142  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.626562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1984  hypothetical protein  29.56 
 
 		 403 aa  124  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4795  RES domain-containing protein  29.6 
 
 		 372 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2135  RES domain protein  24.19 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2225  RES domain-containing protein  25 
 
 		 619 aa  78.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.195226  normal  0.94728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3793  hypothetical protein  25.92 
 
 		 379 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  24.65 
 
 		 343 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4896  RES domain protein  31.52 
 
 		 392 aa  67.4  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0537  hypothetical protein, putative phage gene  27.27 
 
 		 237 aa  51.2  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.264448  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6334  hypothetical protein  31.03 
 
 		 191 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1895  RES domain protein  24 
 
 		 268 aa  47.8  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.655067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>