15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5528 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  326  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  50 
 
 
175 aa  153  7e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  51.32 
 
 
178 aa  152  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  47.13 
 
 
174 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  48.73 
 
 
175 aa  150  8e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  46.05 
 
 
174 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  37.74 
 
 
166 aa  92  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  35.71 
 
 
178 aa  91.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  39.63 
 
 
181 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  34.76 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  32.92 
 
 
173 aa  60.8  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  32.9 
 
 
165 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  31.01 
 
 
168 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  33.12 
 
 
180 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2256  hypothetical protein  30.83 
 
 
343 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>