14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2338 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  361  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  48.73 
 
 		 159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  47.7 
 
 		 174 aa  153  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  48.1 
 
 		 178 aa  146  1.0000000000000001e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  50.3 
 
 		 175 aa  145  3e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  44.87 
 
 		 174 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  36.21 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  36.53 
 
 		 172 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  38.32 
 
 		 181 aa  80.9  0.000000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  36.14 
 
 		 166 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  34.48 
 
 		 165 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  33.14 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  34.88 
 
 		 173 aa  70.1  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  50.7 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>