23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9549 on replicon NC_011991
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  337  5.9999999999999996e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  75.15 
 
 		 168 aa  261  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  73.78 
 
 		 180 aa  256  9e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  60.12 
 
 		 173 aa  214  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  41.82 
 
 		 172 aa  125  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  38.64 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  37.13 
 
 		 181 aa  94.7  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  34.59 
 
 		 166 aa  88.6  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  35.51 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  32.9 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  39.42 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  32.92 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  51.06 
 
 		 176 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  48.08 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  48.94 
 
 		 158 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  32.5 
 
 		 174 aa  44.3  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  31.65 
 
 		 153 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  35.9 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  42.55 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  37.66 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  32.24 
 
 		 175 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  50 
 
 		 155 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>