16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1686 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  100 
 
 
172 aa  352  1e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  46.07 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  45.03 
 
 
181 aa  140  9e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  41.82 
 
 
173 aa  129  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  41.82 
 
 
165 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  41.57 
 
 
166 aa  124  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  41.82 
 
 
168 aa  122  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  39.31 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  37.35 
 
 
174 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  34.76 
 
 
159 aa  81.3  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  36.53 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  38.95 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  34.57 
 
 
178 aa  65.5  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  32.73 
 
 
174 aa  52  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  37.04 
 
 
157 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  38.67 
 
 
151 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>