16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0814 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  358  2e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  73.21 
 
 
178 aa  253  9e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  46.05 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  43.53 
 
 
174 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  44.87 
 
 
175 aa  117  6e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  44.38 
 
 
175 aa  111  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  32.73 
 
 
172 aa  68.9  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  32.52 
 
 
166 aa  67.8  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  32.5 
 
 
165 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  29.59 
 
 
178 aa  58.2  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  32.53 
 
 
168 aa  57.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  33.14 
 
 
180 aa  57.4  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  30.49 
 
 
173 aa  53.5  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  30.86 
 
 
181 aa  50.8  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  26.57 
 
 
152 aa  40.8  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  26.57 
 
 
152 aa  40.8  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>