18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4895 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  100 
 
 
174 aa  355  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  75.86 
 
 
175 aa  256  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  47.13 
 
 
159 aa  151  4e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  47.7 
 
 
175 aa  137  7e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  44.3 
 
 
178 aa  126  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  43.53 
 
 
174 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  38.37 
 
 
178 aa  98.2  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  37.35 
 
 
172 aa  82.8  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  34.38 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  36.36 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  30.99 
 
 
168 aa  59.7  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  36.36 
 
 
180 aa  58.9  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  39.42 
 
 
165 aa  59.3  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  32.33 
 
 
173 aa  57  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  28.67 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  28.67 
 
 
152 aa  41.6  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  28.67 
 
 
152 aa  41.2  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  26.55 
 
 
226 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>