24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_4539 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  100 
 
 		 166 aa  340  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  41.57 
 
 		 172 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  37.21 
 
 		 178 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  34.78 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  37.74 
 
 		 159 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  35 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  34.59 
 
 		 165 aa  88.6  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  33.75 
 
 		 168 aa  83.2  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  36.14 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  34.38 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  34.78 
 
 		 178 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  35.4 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  36.14 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  32.52 
 
 		 174 aa  49.7  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  48.89 
 
 		 152 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  45.65 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  31.86 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  39.58 
 
 		 157 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  36.36 
 
 		 161 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  39.58 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  43.75 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  42.55 
 
 		 158 aa  41.2  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  47.37 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  30 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>