72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1510 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  100 
 
 
161 aa  329  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  66.04 
 
 
165 aa  227  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  59.87 
 
 
159 aa  194  6e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  53.02 
 
 
156 aa  152  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  50.91 
 
 
117 aa  114  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  41.4 
 
 
160 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  41.26 
 
 
153 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  41.84 
 
 
157 aa  103  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  39.49 
 
 
160 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  40.15 
 
 
155 aa  100  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  39.58 
 
 
157 aa  98.2  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  38.73 
 
 
153 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  39.75 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  37.25 
 
 
149 aa  97.1  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  39.75 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  39.75 
 
 
159 aa  97.1  9e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  35.71 
 
 
164 aa  96.7  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  39.35 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  37.66 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  44.12 
 
 
151 aa  94.4  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  40.85 
 
 
157 aa  93.6  9e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  35.9 
 
 
153 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  39.13 
 
 
159 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  39.13 
 
 
159 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  35.48 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  39.13 
 
 
159 aa  93.2  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  35.48 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  39.86 
 
 
157 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  39.86 
 
 
157 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  34.64 
 
 
157 aa  92  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  35.48 
 
 
152 aa  92  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  39.86 
 
 
160 aa  91.7  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  37.91 
 
 
149 aa  91.3  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  38.51 
 
 
158 aa  90.5  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  37.18 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  34.78 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  37.59 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  34.75 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  32.62 
 
 
150 aa  86.3  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  32.74 
 
 
166 aa  84  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  32.74 
 
 
166 aa  84  8e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  36.77 
 
 
148 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  38.24 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  31.55 
 
 
166 aa  82  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  35 
 
 
158 aa  80.5  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  32.52 
 
 
156 aa  80.5  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  34.84 
 
 
145 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  34.84 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  32.17 
 
 
156 aa  77.8  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  38.13 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  32.5 
 
 
157 aa  77  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  32.64 
 
 
156 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  32.17 
 
 
155 aa  75.1  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  33.55 
 
 
145 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  32.53 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  35.43 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  32.26 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  34.51 
 
 
162 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  30.52 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  29.38 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  32.48 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  31.47 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  34.38 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  31.68 
 
 
153 aa  58.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  33.57 
 
 
176 aa  57.4  0.00000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  31.85 
 
 
158 aa  57  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  28.03 
 
 
153 aa  54.3  0.0000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  28.3 
 
 
153 aa  52  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  28.68 
 
 
162 aa  47  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  29.92 
 
 
173 aa  44.3  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  36.36 
 
 
166 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0727  hypothetical protein  41.67 
 
 
76 aa  41.6  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>