72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6617 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  323  5e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  93.08 
 
 
159 aa  308  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  93.08 
 
 
159 aa  308  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  93.08 
 
 
159 aa  308  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  90.57 
 
 
159 aa  302  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  89.94 
 
 
159 aa  301  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  88.46 
 
 
158 aa  291  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  57.14 
 
 
148 aa  169  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  50.34 
 
 
149 aa  142  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  48.98 
 
 
145 aa  138  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  44.78 
 
 
145 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  44.78 
 
 
145 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  44.03 
 
 
145 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  39.13 
 
 
161 aa  92.4  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  34.04 
 
 
136 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  36.31 
 
 
155 aa  87.4  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  33.96 
 
 
157 aa  86.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  37.66 
 
 
153 aa  86.3  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  34.33 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  38.99 
 
 
165 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  35 
 
 
159 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  38.22 
 
 
158 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  35.06 
 
 
153 aa  83.6  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  37.87 
 
 
166 aa  80.9  0.000000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  39.32 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  39.32 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  39.32 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  38.06 
 
 
152 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  33.12 
 
 
153 aa  77.8  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  35.71 
 
 
157 aa  76.6  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  35.06 
 
 
153 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  36.69 
 
 
158 aa  75.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  36.09 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  36.09 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  38.89 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  40 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  36.48 
 
 
156 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  33.54 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  33.12 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  36.88 
 
 
153 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  31.85 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  34.27 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  33.99 
 
 
155 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  31.58 
 
 
149 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  35.9 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  31.13 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  31.21 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  32.7 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  32.62 
 
 
157 aa  64.7  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  34.78 
 
 
153 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  31.45 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  29.29 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  33.55 
 
 
153 aa  62.4  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  30.33 
 
 
160 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  30.88 
 
 
155 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  29.77 
 
 
160 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  27.15 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  33.04 
 
 
159 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  30.87 
 
 
162 aa  58.9  0.00000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  27.97 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  32.89 
 
 
151 aa  55.8  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  35.07 
 
 
176 aa  53.9  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  32.7 
 
 
157 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  28.68 
 
 
155 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  36.15 
 
 
158 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  32.17 
 
 
157 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  32.17 
 
 
157 aa  50.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  33.62 
 
 
117 aa  49.7  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7385  RES domain-containing protein  29.82 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285549 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  29.93 
 
 
168 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0727  hypothetical protein  37.68 
 
 
76 aa  42  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>