69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_1726 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  100 
 
 
165 aa  330  5e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  66.04 
 
 
161 aa  227  5e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  61.15 
 
 
159 aa  191  4e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  56.38 
 
 
156 aa  164  5e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  42.47 
 
 
153 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  47.45 
 
 
157 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  42.18 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  50.94 
 
 
117 aa  104  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  43.36 
 
 
157 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  39.22 
 
 
150 aa  100  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  37.42 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  37.42 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  37.42 
 
 
152 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  41.72 
 
 
160 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  39.46 
 
 
157 aa  99  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  39.46 
 
 
157 aa  98.6  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  41.06 
 
 
160 aa  97.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  41.56 
 
 
148 aa  97.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  38.56 
 
 
157 aa  97.1  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  39.1 
 
 
152 aa  96.7  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  42.54 
 
 
149 aa  97.1  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  39.07 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  43.07 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  40 
 
 
157 aa  93.2  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  32.47 
 
 
164 aa  91.3  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  38.31 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  90.9  8e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  39.26 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  39.26 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  39.26 
 
 
159 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  35.62 
 
 
153 aa  87.4  9e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  38.36 
 
 
159 aa  85.5  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  37.65 
 
 
157 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  36.54 
 
 
155 aa  85.1  4e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  38.99 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  37.11 
 
 
159 aa  84  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  36.96 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  39.01 
 
 
159 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  36.48 
 
 
158 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  32.91 
 
 
156 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  37.35 
 
 
163 aa  81.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  32.28 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  41.91 
 
 
151 aa  80.5  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  37.42 
 
 
145 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  33.33 
 
 
156 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  38.85 
 
 
145 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  32.94 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  32.94 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  37.58 
 
 
145 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  37.58 
 
 
145 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  31.76 
 
 
166 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  32.89 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  35.48 
 
 
151 aa  75.1  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  33.55 
 
 
150 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  30.86 
 
 
157 aa  72  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  32.84 
 
 
154 aa  71.6  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  30.57 
 
 
153 aa  69.3  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  31.51 
 
 
158 aa  67.8  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  35.67 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  33.12 
 
 
153 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  27.27 
 
 
155 aa  61.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  32.48 
 
 
153 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  30.99 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  25.87 
 
 
155 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  36.05 
 
 
176 aa  52.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  29.05 
 
 
150 aa  51.2  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  34.88 
 
 
158 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  31.11 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  29.73 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>