71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3261 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  100 
 
 		 145 aa  294  3e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  99.31 
 
 		 145 aa  292  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  95.86 
 
 		 145 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  72.22 
 
 		 145 aa  212  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  48.55 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  48.89 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  44.22 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  44.22 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  44.22 
 
 		 159 aa  114  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  44.78 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  42.86 
 
 		 159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  44.22 
 
 		 158 aa  111  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  42.18 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  38.82 
 
 		 150 aa  86.3  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  36.54 
 
 		 159 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  39.87 
 
 		 157 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  36.36 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  37.42 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  38.71 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  34.07 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  38.96 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  34.78 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  39.16 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  40 
 
 		 153 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  34.48 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  34.84 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  37.58 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  35.71 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  36.96 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  31.91 
 
 		 164 aa  73.9  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  34.59 
 
 		 156 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  35.48 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  36.5 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  37.32 
 
 		 156 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  34.75 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  34.59 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  36.69 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  32.74 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  32.08 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  34.51 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  32.14 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  32.14 
 
 		 166 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  33.09 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  34.44 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  31.21 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  33.11 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  33.07 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  33.58 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  33.77 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  31.21 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  32.85 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  32.85 
 
 		 152 aa  60.5  0.000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  31.41 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  33.09 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  32.74 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  28.47 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  32.7 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  32.85 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  33.09 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  33.12 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  33.09 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  32.14 
 
 		 160 aa  52.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  28.67 
 
 		 150 aa  50.8  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  28.67 
 
 		 160 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  33.62 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  33.62 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  27.86 
 
 		 162 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  34.26 
 
 		 117 aa  47  0.00008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  26.32 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3122  hypothetical protein  29.58 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  25.16 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>