27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3122 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3122  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  344  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4771  RES domain-containing protein  56.38 
 
 		 163 aa  177  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7385  RES domain-containing protein  47.27 
 
 		 166 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285549 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  50.34 
 
 		 168 aa  151  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  25.97 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  33.91 
 
 		 155 aa  51.2  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  28.47 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  33.33 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  28.26 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  30.77 
 
 		 156 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  27.74 
 
 		 157 aa  46.6  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  29.66 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  29.66 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  29.66 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  29.66 
 
 		 152 aa  45.1  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  29.71 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  31.29 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  28.08 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  29.58 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  25 
 
 		 153 aa  43.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  27.95 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  25.97 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  30.61 
 
 		 145 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  25 
 
 		 153 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  26.88 
 
 		 157 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  30.43 
 
 		 157 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  29.63 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>