49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7385 on replicon NC_010627
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010627  Bphy_7385  RES domain-containing protein  100 
 
 
166 aa  337  5e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285549 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  55.83 
 
 
168 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4771  RES domain-containing protein  53.21 
 
 
163 aa  171  3.9999999999999995e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3122  hypothetical protein  47.27 
 
 
167 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  29.3 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  35.11 
 
 
153 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  31.17 
 
 
153 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  28.93 
 
 
153 aa  55.5  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  31.41 
 
 
156 aa  54.3  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  32.05 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  28.66 
 
 
157 aa  52.4  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  30.13 
 
 
155 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  29.41 
 
 
156 aa  51.2  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  28.66 
 
 
157 aa  51.2  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  32.81 
 
 
154 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  30.3 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  26.8 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  26.58 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  29.88 
 
 
157 aa  48.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  28.26 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  28.24 
 
 
148 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  31.19 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  31.11 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  32.48 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  30.57 
 
 
157 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  34.59 
 
 
160 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  29.41 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  27.85 
 
 
152 aa  45.1  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  33.33 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  27.39 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  27.39 
 
 
152 aa  44.3  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  29.82 
 
 
159 aa  44.3  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  25.32 
 
 
150 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  28.45 
 
 
149 aa  44.7  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  26.75 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  28.48 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  27.56 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  28.48 
 
 
151 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  28.57 
 
 
159 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  28.95 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  36.21 
 
 
160 aa  42.4  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  27.73 
 
 
159 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  29.41 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  28.95 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  28.95 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  29.32 
 
 
149 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  33.33 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  28.32 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  28.32 
 
 
166 aa  40.8  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.40303 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>