42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5271 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  100 
 
 		 168 aa  342  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4771  RES domain-containing protein  66.26 
 
 		 163 aa  220  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7385  RES domain-containing protein  55.83 
 
 		 166 aa  177  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3122  hypothetical protein  50.34 
 
 		 167 aa  151  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  32.86 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  37.39 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  33.85 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  31.78 
 
 		 157 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  33.55 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  34.51 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  52  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  32.9 
 
 		 157 aa  51.2  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  32.69 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  27.52 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  29.11 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  32.91 
 
 		 153 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  35.03 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  29.22 
 
 		 154 aa  48.5  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  32.41 
 
 		 150 aa  48.5  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  30.86 
 
 		 156 aa  47.8  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  46.94 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  32.87 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  28.95 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  34.34 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  29.22 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  42.31 
 
 		 153 aa  45.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  44 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  29.63 
 
 		 156 aa  44.7  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  27.91 
 
 		 164 aa  44.3  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  30.82 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  29.01 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  31.5 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  44.9 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  53.33 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  31.25 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  29.93 
 
 		 159 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  31.25 
 
 		 166 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  27.27 
 
 		 163 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  27.1 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  26.45 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  25.16 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>