77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0567 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  320  3e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  58.55 
 
 
155 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  45.28 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  44.08 
 
 
152 aa  115  3e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  44.65 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  43.9 
 
 
157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  36.54 
 
 
164 aa  111  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  39.24 
 
 
153 aa  108  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  40.41 
 
 
153 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  41.92 
 
 
166 aa  107  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  41.92 
 
 
166 aa  107  9.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  40.27 
 
 
157 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  39.86 
 
 
157 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  40.72 
 
 
166 aa  102  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  37.42 
 
 
156 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  40 
 
 
157 aa  98.6  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  36.25 
 
 
156 aa  98.2  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  39.35 
 
 
161 aa  96.3  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  36.42 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  36.42 
 
 
152 aa  95.5  3e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  35.48 
 
 
156 aa  94.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  36.42 
 
 
152 aa  94.7  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  36.91 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  36.31 
 
 
154 aa  92.4  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  36.67 
 
 
155 aa  92  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  34.76 
 
 
162 aa  92  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  40 
 
 
165 aa  90.9  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  38.06 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  36.18 
 
 
159 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  37.58 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  37.58 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  37.58 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  36.36 
 
 
153 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  39.52 
 
 
157 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  34.64 
 
 
153 aa  84.7  5e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  38.31 
 
 
153 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  38.22 
 
 
159 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  33.55 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  37.06 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  36.23 
 
 
160 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  38.13 
 
 
156 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  31.21 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  36.96 
 
 
160 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  36 
 
 
149 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  35.06 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  37.18 
 
 
153 aa  78.2  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  36.18 
 
 
150 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0872  RES domain protein  30.57 
 
 
155 aa  77.4  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  33.77 
 
 
153 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  34.39 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  34.39 
 
 
159 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  32.48 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  31.01 
 
 
150 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  35.67 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  33.77 
 
 
148 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2978  RES domain protein  35.61 
 
 
151 aa  72  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224738  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  36.62 
 
 
176 aa  70.1  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  32.21 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  36.24 
 
 
158 aa  68.2  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  34.44 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  31.47 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  33.77 
 
 
163 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  34.59 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  34.09 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0856  RES domain protein  29.68 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  33.09 
 
 
145 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  33.09 
 
 
145 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4771  RES domain-containing protein  48.98 
 
 
163 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  35.35 
 
 
117 aa  45.1  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.315293 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  44 
 
 
168 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7385  RES domain-containing protein  33.33 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285549 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  43.48 
 
 
173 aa  42.4  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3122  hypothetical protein  25.97 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4540  hypothetical protein  42 
 
 
189 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  42.55 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0727  hypothetical protein  36 
 
 
76 aa  40.8  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>