68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3736 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A3736  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  314  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5010  RES domain-containing protein  60.13 
 
 		 153 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3577  RES domain protein  58.82 
 
 		 153 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3791  hypothetical protein  54.9 
 
 		 153 aa  188  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.217882  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21800  hypothetical protein  38.96 
 
 		 145 aa  89.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925886  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4184  hypothetical protein  33.99 
 
 		 148 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0567  hypothetical protein  36.36 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.124233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2079  RES domain-containing protein  38.71 
 
 		 145 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1397  hypothetical protein  33.99 
 
 		 149 aa  84.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.287253 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6689  RES domain-containing protein  34.42 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90832  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5846  hypothetical protein  34.42 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6213  hypothetical protein  34.42 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.283116  hitchhiker  0.00614961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2003  RES domain protein  35.26 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.553327  normal  0.244891 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2434  RES domain-containing protein  37.42 
 
 		 145 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1638  RES domain protein  34.39 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3261  RES domain-containing protein  37.42 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.145024  normal  0.45407 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2980  RES domain-containing protein  36.08 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.479555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6000  hypothetical protein  34.84 
 
 		 155 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5333  RES domain-containing protein  33.12 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.287925  normal  0.0378927 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6617  hypothetical protein  33.12 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5745  RES domain-containing protein  33.12 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.72547 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5989  hypothetical protein  32.9 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.614311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2185  RES domain protein  31.45 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3684  RES domain protein  30.13 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0717543  normal  0.075998 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1503  hypothetical protein  31.41 
 
 		 164 aa  74.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2091  RES domain protein  31.25 
 
 		 157 aa  73.9  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1751  hypothetical protein  30.63 
 
 		 157 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3314  RES domain protein  31.21 
 
 		 150 aa  72  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.294409 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4211  hypothetical protein  30.6 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000117445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0918  hypothetical protein  31.91 
 
 		 155 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1726  RES domain protein  30.57 
 
 		 165 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.550147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3247  hypothetical protein  30.81 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2531  hypothetical protein  33.58 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1792  hypothetical protein  33.58 
 
 		 152 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1900  RES domain-containing protein  33.58 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.548164  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5232  hypothetical protein  30.13 
 
 		 157 aa  67.8  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2462  RES domain-containing protein  31.51 
 
 		 156 aa  67  0.00000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.763575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0884  hypothetical protein  29.17 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1139  RES domain protein  29.85 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.274771  normal  0.0153723 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3769  RES domain protein  30.19 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1037  hypothetical protein  29.86 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0529  RES domain protein  30.23 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.40303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2340  RES domain protein  31.45 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6757  RES domain-containing protein  28.12 
 
 		 159 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.529209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0544  RES domain-containing protein  30.23 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.372513  normal  0.122557 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6456  RES domain protein  30.5 
 
 		 160 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.558067  normal  0.0752722 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6278  RES domain protein  31.21 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.408611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4967  RES  28.39 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.928645  normal  0.913014 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000264  hypothetical protein  31.87 
 
 		 156 aa  62.8  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5026  hypothetical protein  29.87 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5424  RES domain-containing protein  31.21 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0585482  normal  0.529196 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05636  hypothetical protein  31.48 
 
 		 156 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2118  RES domain protein  32.14 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0310732  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0494  hypothetical protein  31.43 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990704 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3603  RES domain protein  30.97 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1510  RES domain-containing protein  28.03 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.283416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3818  RES domain protein  28.66 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0119387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0875  RES domain protein  31.43 
 
 		 158 aa  53.5  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0458  RES domain protein  33.61 
 
 		 153 aa  50.8  0.000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0948584  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1541  RES domain protein  30.08 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0894611  normal  0.186684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3860  RES domain protein  31.16 
 
 		 162 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000550173  normal  0.493922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3703  RES domain protein  26.11 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000090185  unclonable  0.00000000000000341993 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5847  RES domain-containing protein  30.06 
 
 		 157 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2340  RES domain protein  31.58 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.641708  normal  0.687638 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5271  RES domain protein  42.31 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.403889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2142  RES domain protein  28.36 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4771  RES domain-containing protein  28.3 
 
 		 163 aa  44.3  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.231437 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0494  hypothetical protein  42.65 
 
 		 117 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.315293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>