14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5099 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5099  RES domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.033489  normal  0.48502 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1442  RES domain-containing protein  56.5 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1686  RES domain protein  46.07 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4546  hypothetical protein  37.97 
 
 		 180 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130153  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4974  RES domain-containing protein  36.22 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3368  hypothetical protein  36.09 
 
 		 173 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.109584  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9549  hypothetical protein  38.64 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.207338  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4895  RES domain-containing protein  38.37 
 
 		 174 aa  98.2  6e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4539  RES domain-containing protein  37.21 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5528  hypothetical protein  35.71 
 
 		 159 aa  91.7  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.756531 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9507  hypothetical protein  38.01 
 
 		 175 aa  84.7  6e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.127504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2338  hypothetical protein  36.21 
 
 		 175 aa  84.3  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32410  hypothetical protein  31.74 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0814  hypothetical protein  29.59 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.989185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>