59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5567 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  98.7 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  91.74 
 
 		 233 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  91.74 
 
 		 233 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  91.74 
 
 		 233 aa  440  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  90.04 
 
 		 231 aa  436  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  92.69 
 
 		 233 aa  421  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  83.04 
 
 		 235 aa  400  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  83.48 
 
 		 235 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  83.48 
 
 		 235 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  83.11 
 
 		 235 aa  396  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  74.67 
 
 		 233 aa  360  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  75.89 
 
 		 233 aa  354  5e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  73.04 
 
 		 233 aa  353  7.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  67.41 
 
 		 226 aa  318  3.9999999999999996e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  50.45 
 
 		 229 aa  231  8.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  41.82 
 
 		 227 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  40.36 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  40.65 
 
 		 323 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  41.28 
 
 		 230 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  41.01 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  37.09 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  37.09 
 
 		 225 aa  146  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  38.29 
 
 		 223 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  38.68 
 
 		 226 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  39.17 
 
 		 235 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  38.12 
 
 		 227 aa  141  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  38.25 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  37.16 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  37.93 
 
 		 231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  40.51 
 
 		 190 aa  116  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  33.84 
 
 		 221 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  35.35 
 
 		 231 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  37.88 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  38.04 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  32.68 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  32.2 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  37.33 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  34.5 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  28.44 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  28 
 
 		 244 aa  85.5  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  30.19 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  34.93 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  31.62 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  26.87 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  35.2 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  27.61 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  36.67 
 
 		 254 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  33.09 
 
 		 255 aa  53.1  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  29.55 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  27.54 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  29.85 
 
 		 242 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  35.96 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  34.45 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  34.78 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  26.81 
 
 		 227 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  34.45 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  35.34 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1342  hypothetical protein  28.47 
 
 		 264 aa  42  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.962002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>