50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2009 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  100 
 
 
238 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  60.18 
 
 
237 aa  294  8e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  48.71 
 
 
242 aa  230  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  43.91 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  39.66 
 
 
228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  41.45 
 
 
230 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  40.25 
 
 
227 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1813  hypothetical protein  58.33 
 
 
81 aa  89  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000218616  normal  0.608406 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  33.82 
 
 
227 aa  85.9  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  30.88 
 
 
323 aa  84.3  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  35.53 
 
 
229 aa  83.2  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  29.91 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  32.21 
 
 
226 aa  76.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  31.54 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  32.5 
 
 
227 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  33.56 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  30.87 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  32 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  34.93 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  34.56 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  34.56 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  32.88 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  34.72 
 
 
223 aa  70.1  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  32.89 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  32.89 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  34.25 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  32.19 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  32.21 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  32.19 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  29.11 
 
 
232 aa  68.6  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  32.19 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  30.2 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  28.7 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  30.27 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  32.48 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  30.87 
 
 
227 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  25.18 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  26.7 
 
 
229 aa  51.2  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2930  hypothetical protein  32.65 
 
 
246 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.273415 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  25.9 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  23.94 
 
 
221 aa  49.3  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  26.73 
 
 
231 aa  48.9  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  30 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  23.24 
 
 
221 aa  46.6  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  26.62 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  28.87 
 
 
232 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2776  RES domain protein  36.46 
 
 
218 aa  43.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  27.35 
 
 
237 aa  42.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  24.77 
 
 
230 aa  42.4  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  26.62 
 
 
223 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>