61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0557 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  480  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  96.17 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  96.17 
 
 
235 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  95.32 
 
 
235 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  83.11 
 
 
231 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  84.07 
 
 
233 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  84.07 
 
 
233 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  84.07 
 
 
233 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  83.56 
 
 
231 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  83.04 
 
 
231 aa  391  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  84.93 
 
 
233 aa  387  1e-107  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  76.65 
 
 
233 aa  363  1e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  77.09 
 
 
233 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  77.09 
 
 
233 aa  357  9e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  66.07 
 
 
226 aa  311  6.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  51.35 
 
 
229 aa  234  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  42.41 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  41.74 
 
 
244 aa  159  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  40.19 
 
 
323 aa  150  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  37.44 
 
 
226 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  39.37 
 
 
223 aa  148  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  35.68 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  41.55 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  41.36 
 
 
230 aa  144  1e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  35.21 
 
 
225 aa  144  1e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  38.25 
 
 
227 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  41.58 
 
 
231 aa  135  4e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  38.6 
 
 
235 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  38.14 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  34.55 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  35.35 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  40.76 
 
 
223 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  40 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  38.89 
 
 
223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  35.86 
 
 
231 aa  109  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  35.35 
 
 
221 aa  105  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  34.85 
 
 
221 aa  103  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  38.53 
 
 
233 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  34.07 
 
 
232 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  30.19 
 
 
226 aa  85.5  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  29.11 
 
 
229 aa  85.5  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  27.35 
 
 
244 aa  82  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  30.27 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  27.86 
 
 
235 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  29.85 
 
 
237 aa  61.6  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  35.2 
 
 
244 aa  57.8  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  29.85 
 
 
238 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  34.23 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  30.23 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1321  hypothetical protein  36.84 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  28.36 
 
 
228 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  33.33 
 
 
245 aa  47  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  27.33 
 
 
242 aa  45.8  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0638  hypothetical protein  34.33 
 
 
255 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7303  RES domain-containing protein  33.64 
 
 
241 aa  43.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00177332 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2812  hypothetical protein  30.82 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.879508  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0106  RES domain protein  36.97 
 
 
221 aa  42.4  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.117928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3224  hypothetical protein  31.3 
 
 
220 aa  42  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  26.5 
 
 
227 aa  42  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  32.23 
 
 
251 aa  42  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  32.23 
 
 
252 aa  42  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>