54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2378 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  453  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  88.11 
 
 		 227 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  88 
 
 		 235 aa  403  1e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  56.14 
 
 		 244 aa  251  6e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  56.95 
 
 		 323 aa  251  8.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  54.19 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  50.67 
 
 		 232 aa  238  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  45.25 
 
 		 229 aa  178  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  46.48 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  40.76 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  42.47 
 
 		 225 aa  158  5e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  42.01 
 
 		 225 aa  155  6e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  38.16 
 
 		 226 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  37.84 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  37.84 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  37.84 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  37.16 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  37.5 
 
 		 233 aa  142  5e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  38.12 
 
 		 231 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  38.57 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  38.57 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  38.12 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  42.08 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  38.57 
 
 		 235 aa  139  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  35.68 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  37.5 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  36.94 
 
 		 231 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  38.25 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  32.08 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  35.38 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  36.49 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  32.42 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  38.38 
 
 		 223 aa  100  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  35.35 
 
 		 221 aa  94.7  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  32.97 
 
 		 190 aa  94.7  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  34.85 
 
 		 221 aa  92.4  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  36.36 
 
 		 231 aa  91.7  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  33.82 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  30.48 
 
 		 244 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  35.86 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  35.71 
 
 		 233 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  32.66 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  32.7 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  30.63 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  31.13 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  30.19 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  30.1 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  31.82 
 
 		 230 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  26.94 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1716  hypothetical protein  28.71 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.218675  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  29.41 
 
 		 244 aa  45.1  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  29.63 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  31.86 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  31.71 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>