57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0456 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  96.92 
 
 		 235 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  88.11 
 
 		 227 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  56.39 
 
 		 323 aa  255  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  56.31 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  54.91 
 
 		 244 aa  248  7e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  50 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  46.01 
 
 		 229 aa  177  8e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  44.24 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  39.35 
 
 		 227 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  40.65 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  40.65 
 
 		 225 aa  152  4e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  37.79 
 
 		 226 aa  148  7e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  38.89 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  38.89 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  38.89 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  37.96 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  37.33 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  38.71 
 
 		 231 aa  142  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  38.25 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  38.43 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  37.79 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  36.74 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  41.58 
 
 		 231 aa  138  7.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  38.6 
 
 		 235 aa  137  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  38.14 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  38.14 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  38.14 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  31.63 
 
 		 226 aa  131  9e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  35.85 
 
 		 230 aa  118  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  34.58 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  37.88 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  37.56 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  37.07 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  38.89 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  36.36 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  30.27 
 
 		 190 aa  89.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  29.52 
 
 		 244 aa  84.7  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  35.35 
 
 		 223 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  32.5 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  31.05 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  34.38 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  30.88 
 
 		 232 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  31.75 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1661  hypothetical protein  29.21 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.214011  normal  0.933479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  30.46 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2467  hypothetical protein  27.4 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  26.48 
 
 		 226 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0058  RES domain protein  31.72 
 
 		 227 aa  51.6  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2805  hypothetical protein  31.13 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0485021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4131  RES domain-containing protein  36.79 
 
 		 256 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.897628  hitchhiker  0.00202001 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  32.14 
 
 		 245 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  25.39 
 
 		 235 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0367  hypothetical protein  35.48 
 
 		 254 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  28.43 
 
 		 244 aa  43.9  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4353  RES domain-containing protein  37.07 
 
 		 252 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00618005  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51010  hypothetical protein  37.07 
 
 		 251 aa  42.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000099765  hitchhiker  0.000000308389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>