49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2907 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2907  hypothetical protein  100 
 
 
231 aa  488  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26280  hypothetical protein  51.13 
 
 
223 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1859  hypothetical protein  48.62 
 
 
227 aa  224  6e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.940668  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1569  hypothetical protein  46.45 
 
 
225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1421  hypothetical protein  45.97 
 
 
225 aa  193  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3799  hypothetical protein  46.53 
 
 
229 aa  174  9.999999999999999e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1493  hypothetical protein  42.44 
 
 
226 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.492575  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4397  RES domain-containing protein  39.9 
 
 
233 aa  144  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0898886 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2857  hypothetical protein  40.69 
 
 
233 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6815  RES domain protein  40.1 
 
 
233 aa  141  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.809178  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2378  hypothetical protein  42.08 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.162377 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0456  hypothetical protein  41.58 
 
 
227 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0557  hypothetical protein  41.58 
 
 
235 aa  135  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0812489  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2110  hypothetical protein  41.09 
 
 
235 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3584  RES domain-containing protein  37.74 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.287485  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2469  hypothetical protein  41.09 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.06436  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2608  hypothetical protein  41.09 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0904  hypothetical protein  41.09 
 
 
235 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4520  hypothetical protein  38.92 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3844  hypothetical protein  38.92 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3683  RES domain-containing protein  38.92 
 
 
233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.47923  normal  0.0822652 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5567  hypothetical protein  37.93 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4900  RES domain-containing protein  38.42 
 
 
233 aa  125  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188878  hitchhiker  0.000115649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3741  RES domain-containing protein  36.57 
 
 
231 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473719  normal  0.209081 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2252  hypothetical protein  38.42 
 
 
231 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0499853  normal  0.107055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3064  RES domain protein  38.46 
 
 
237 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.35237  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2207  hypothetical protein  37.38 
 
 
323 aa  121  9.999999999999999e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00851405  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2933  RES domain-containing protein  34.69 
 
 
221 aa  120  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.727941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0635  hypothetical protein  37.5 
 
 
230 aa  118  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0435  hypothetical protein  37.02 
 
 
244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.379995  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3486  RES domain-containing protein  34.13 
 
 
226 aa  116  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.101439 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0245  hypothetical protein  32.65 
 
 
221 aa  104  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0679  hypothetical protein  37.57 
 
 
190 aa  102  7e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201046  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7073  RES domain protein  33.83 
 
 
231 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.000495065  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0270  hypothetical protein  32.14 
 
 
221 aa  101  1e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.561414  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2368  RES domain-containing protein  32.86 
 
 
223 aa  96.7  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.334094  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5936  RES domain protein  34.18 
 
 
223 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.248012 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00942  hypothetical protein  27.19 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2891  hypothetical protein  33.01 
 
 
233 aa  77  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3924  hypothetical protein  35.68 
 
 
232 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4483  hypothetical protein  26.96 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0030  hypothetical protein  25.45 
 
 
244 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4082  hypothetical protein  24.53 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.769108  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2009  RES domain protein  26.73 
 
 
238 aa  48.9  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0253482  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1072  hypothetical protein  27.36 
 
 
242 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000933482  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2715  RES domain protein  27.64 
 
 
238 aa  46.6  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.47969 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0589  hypothetical protein  32.11 
 
 
245 aa  45.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2227  RES domain protein  27.41 
 
 
237 aa  45.4  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2247  RES domain protein  27.45 
 
 
244 aa  42.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>