90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3714 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  313  5e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  64.08 
 
 
146 aa  188  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  55.56 
 
 
150 aa  165  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  51.06 
 
 
136 aa  147  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  51.06 
 
 
141 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  51.06 
 
 
141 aa  147  6e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  52.17 
 
 
147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  51.09 
 
 
152 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  50.35 
 
 
141 aa  140  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  44.76 
 
 
146 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  42.55 
 
 
137 aa  117  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  43.15 
 
 
146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  36.81 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  44.37 
 
 
143 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  34.07 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  34.07 
 
 
140 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  34.07 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  36.43 
 
 
143 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  32.17 
 
 
142 aa  80.9  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  34.09 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  31.58 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  33.07 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  36.29 
 
 
141 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  35.62 
 
 
167 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  35.94 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  35.94 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  35.94 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  34.88 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  33.85 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  34.68 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  32.19 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  32.54 
 
 
144 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  36.29 
 
 
179 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  27.67 
 
 
190 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  31.51 
 
 
146 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  35 
 
 
156 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  33.86 
 
 
135 aa  53.9  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  32.14 
 
 
138 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  33.08 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  32.28 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  32.28 
 
 
152 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  24.69 
 
 
166 aa  50.8  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  26.14 
 
 
168 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  32.31 
 
 
182 aa  49.7  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  33.59 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  27.27 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  31.71 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  32.82 
 
 
358 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  33.09 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  24.31 
 
 
170 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  30.77 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4216  hypothetical protein  33.06 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.435307  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  27.94 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  31.58 
 
 
181 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  31.71 
 
 
153 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  27.74 
 
 
174 aa  47.4  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3626  hypothetical protein  31.58 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  28.32 
 
 
157 aa  47.4  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  27.21 
 
 
158 aa  47  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  30.71 
 
 
138 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  28.24 
 
 
168 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  24.65 
 
 
152 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  32.33 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  25.66 
 
 
190 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  24.44 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  26.9 
 
 
450 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  31.5 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  27.66 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  29.69 
 
 
129 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  33.61 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  28.91 
 
 
152 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1946  hypothetical protein  28 
 
 
164 aa  43.9  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.733972  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  28.1 
 
 
154 aa  43.9  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  30.22 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  28.12 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  26.76 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  29.23 
 
 
163 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  33.7 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  26.43 
 
 
187 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2917  hypothetical protein  28.57 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  27.33 
 
 
165 aa  41.2  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  24.11 
 
 
145 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  26.53 
 
 
180 aa  41.2  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  28.68 
 
 
145 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1984  hypothetical protein  27.1 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  29.37 
 
 
206 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  28.57 
 
 
163 aa  40.8  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  27.86 
 
 
185 aa  40.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>