41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4715 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  100 
 
 		 187 aa  384  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  37.08 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6826  hypothetical protein  39.31 
 
 		 184 aa  98.2  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1219  hypothetical protein  34.57 
 
 		 190 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.13958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  33.89 
 
 		 181 aa  88.6  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  40.94 
 
 		 179 aa  88.2  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  33.54 
 
 		 180 aa  87.8  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1570  hypothetical protein  31.93 
 
 		 174 aa  85.1  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.318441  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  32.16 
 
 		 178 aa  84.3  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  33.33 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  31.85 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  34.48 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  36.31 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  33.95 
 
 		 185 aa  75.5  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  35.34 
 
 		 174 aa  75.1  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  32.02 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  35.15 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  33.92 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  32.93 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  33.54 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  33.54 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  33.54 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  32.21 
 
 		 166 aa  70.5  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  32.32 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  32.31 
 
 		 358 aa  69.7  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1296  gamma-BHC dehydrochlorinase  31.18 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.956096  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  30.59 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  31.41 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  32.84 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5505  hypothetical protein  28.07 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  28.67 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  28.39 
 
 		 161 aa  50.1  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  26.75 
 
 		 157 aa  47.8  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  29.14 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  29.32 
 
 		 138 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  30.07 
 
 		 150 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5042  hypothetical protein  26.44 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.723187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  27.85 
 
 		 163 aa  44.7  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  29.46 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  29.85 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  28.48 
 
 		 450 aa  42.4  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>