38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2525 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  328  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  44.76 
 
 
161 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  33.57 
 
 
158 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  33.08 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  31.58 
 
 
206 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  33.57 
 
 
190 aa  62  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  34.06 
 
 
181 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  31.88 
 
 
192 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  25.69 
 
 
170 aa  57  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  32.59 
 
 
208 aa  54.7  0.0000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  28.67 
 
 
187 aa  54.3  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  27.97 
 
 
185 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  27.97 
 
 
185 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  30.2 
 
 
209 aa  52.4  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  25.93 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  27.74 
 
 
166 aa  50.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2633  hypothetical protein  26.15 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.708671  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2648  hypothetical protein  26.15 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324973  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2604  hypothetical protein  26.15 
 
 
149 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  31.82 
 
 
174 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  30.72 
 
 
185 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  36.45 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  29.2 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  29.2 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  29.2 
 
 
185 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  31.88 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  29.63 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  30.23 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  34.88 
 
 
144 aa  44.3  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  28.48 
 
 
165 aa  44.3  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  30.23 
 
 
182 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  29.73 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  26.28 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  29.2 
 
 
185 aa  42.4  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  27.7 
 
 
146 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  22.22 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  27.52 
 
 
180 aa  40.4  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  29.63 
 
 
145 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>