87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2736 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  100 
 
 		 145 aa  297  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  38.28 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13509  hypothetical protein  32.5 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1490  hypothetical protein  31.43 
 
 		 148 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318534 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  32.87 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1179  hypothetical protein  30.66 
 
 		 155 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1169  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1152  hypothetical protein  29.93 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  30.47 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4928  hypothetical protein  29.1 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  30.25 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2408  hypothetical protein  32.8 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  33.87 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  29.69 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5494  gamma-BHC dehydrochlorinase  31.58 
 
 		 182 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.766656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  29.13 
 
 		 133 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2899  hypothetical protein  32.33 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.227669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  31.06 
 
 		 185 aa  51.2  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  28.46 
 
 		 143 aa  50.8  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  27.69 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3759  hypothetical protein  30.66 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.800623  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.69 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3464  hypothetical protein  31.78 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1101  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  33.82 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.699365  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  30.08 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  29.92 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  30.71 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  28.68 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  28.28 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  28.91 
 
 		 152 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  29.79 
 
 		 156 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4660  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  31.4 
 
 		 137 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  25.78 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1719  hypothetical protein  28.89 
 
 		 152 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.621993  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  25.55 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  29.79 
 
 		 144 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  30.33 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0390  hypothetical protein  36.05 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.700266 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  28.46 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  29.84 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  34.57 
 
 		 172 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4010  hypothetical protein  28.46 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  25.18 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  32.17 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  31.78 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  22.73 
 
 		 181 aa  43.5  0.0009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  30.88 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1359  hypothetical protein  25.78 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.17438  normal  0.585219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  28.46 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  27.78 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5648  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  26.17 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  36.51 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  36.51 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  36.51 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  28.24 
 
 		 144 aa  42  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  32.56 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  36.51 
 
 		 185 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  22.63 
 
 		 166 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  28.24 
 
 		 139 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4104  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  28.8 
 
 		 149 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  28.12 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2296  hypothetical protein  32.58 
 
 		 141 aa  41.2  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.168074  hitchhiker  0.00236318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  28.12 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  26.55 
 
 		 170 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4956  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase beta subunit  22.79 
 
 		 162 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.255127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1674  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  25.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0631  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  25.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0549  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  25.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0534  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  25.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1648  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  25.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.341272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  25 
 
 		 451 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1699  3-phenylpropionate dioxygenase subunit beta  25.5 
 
 		 184 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  33.85 
 
 		 185 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3722  hypothetical protein  27.96 
 
 		 166 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.877907  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  28.91 
 
 		 168 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  27.41 
 
 		 166 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  23.89 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  26.21 
 
 		 182 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4587  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  23.36 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.892698  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3776  aromatic-ring-hydroxylating dioxygenase, beta subunit  23.36 
 
 		 158 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.408818 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  25.93 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  29.63 
 
 		 159 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  26.19 
 
 		 136 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  26.19 
 
 		 141 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  26.19 
 
 		 141 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>