25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0536 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  375  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  45.68 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  27.85 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  30.82 
 
 		 158 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  27.34 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  31.62 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  28.47 
 
 		 163 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  26.95 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  29.5 
 
 		 147 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  23.23 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  27.94 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2805  hypothetical protein  24.4 
 
 		 243 aa  48.5  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00093788  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  27.61 
 
 		 166 aa  48.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1769  hypothetical protein  26.28 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  28.78 
 
 		 147 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2216  hypothetical protein  25.31 
 
 		 170 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.931621  normal  0.927101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  28.03 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  25.18 
 
 		 145 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  30.66 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  26.81 
 
 		 156 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  28.28 
 
 		 151 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  30.83 
 
 		 179 aa  42  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  27.27 
 
 		 192 aa  41.6  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1825  hypothetical protein  26.11 
 
 		 172 aa  41.6  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.668279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0375  putative bile acid 7-alpha dehydratase  28.1 
 
 		 171 aa  41.2  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>