18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3359 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  77.34 
 
 		 209 aa  328  3e-89  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  66.83 
 
 		 208 aa  288  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  45.98 
 
 		 190 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  41.36 
 
 		 192 aa  144  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  32.14 
 
 		 165 aa  72  0.000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  34.44 
 
 		 163 aa  65.5  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  31.58 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  27.94 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  30.77 
 
 		 161 aa  48.5  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1465  hypothetical protein  30.28 
 
 		 149 aa  47.8  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.726298  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  35.48 
 
 		 158 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  29.14 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  35.04 
 
 		 163 aa  45.1  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  29.94 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  33.56 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  24.82 
 
 		 190 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  29.55 
 
 		 139 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>