24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3611 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  100 
 
 
209 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  77.34 
 
 
206 aa  328  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  62.93 
 
 
208 aa  274  6e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  46.11 
 
 
192 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  44.89 
 
 
190 aa  141  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  31.68 
 
 
165 aa  65.1  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  33.99 
 
 
163 aa  62.8  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1465  hypothetical protein  31.11 
 
 
149 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.726298  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2525  hypothetical protein  30.2 
 
 
159 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.192284  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  30.43 
 
 
161 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0536  hypothetical protein  26.95 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  31.5 
 
 
166 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  34.96 
 
 
158 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  26.57 
 
 
164 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  29.86 
 
 
181 aa  45.8  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2280  hypothetical protein  29.31 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.137865 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1548  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  28.77 
 
 
184 aa  43.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0254023 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  30.66 
 
 
151 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  27.21 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  27.21 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  27.21 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  26.12 
 
 
190 aa  42.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  27.61 
 
 
139 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>