43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3768 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3768  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  296  7e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3656  hypothetical protein  46.15 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  38.58 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  35.06 
 
 		 450 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  36.96 
 
 		 138 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  32.37 
 
 		 181 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  34.03 
 
 		 166 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3513  hypothetical protein  36.03 
 
 		 155 aa  57.4  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.833088  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  30.16 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  30.77 
 
 		 180 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  29.33 
 
 		 190 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  29.2 
 
 		 172 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  33.85 
 
 		 158 aa  50.1  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4401  hypothetical protein  37.18 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3359  hypothetical protein  33.56 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  33.96 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  23.45 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  25 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  29.05 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  28.46 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3531  hypothetical protein  31.25 
 
 		 358 aa  47  0.00009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0320  hypothetical protein  37.74 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.581982 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0675  hypothetical protein  30.28 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.635996 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4715  gamma-BHC dehydrochlorinase  29.85 
 
 		 187 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.258333 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  36.07 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2149  enzyme  31.85 
 
 		 208 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3611  hypothetical protein  31.16 
 
 		 209 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.492259  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  27.07 
 
 		 185 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  30.66 
 
 		 183 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  27.41 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0580  hypothetical protein  32 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014628 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  35.56 
 
 		 157 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3920  hypothetical protein  35.14 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1025  hypothetical protein  28.37 
 
 		 180 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.848234  normal  0.057955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  27.07 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  29.25 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6884  hypothetical protein  29.8 
 
 		 192 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  30.53 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1984  hypothetical protein  26.19 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.13 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  28.57 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3527  hypothetical protein  29.01 
 
 		 144 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.471983  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  29.13 
 
 		 133 aa  40  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>