15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1737 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  100 
 
 
166 aa  331  2e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  28.83 
 
 
166 aa  68.9  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  28.57 
 
 
160 aa  61.6  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  35.78 
 
 
157 aa  55.8  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0906  hypothetical protein  25.79 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6762  hypothetical protein  26.67 
 
 
151 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  24.48 
 
 
146 aa  44.7  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  29.58 
 
 
137 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  28.23 
 
 
139 aa  44.3  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1771  hypothetical protein  25.47 
 
 
154 aa  42.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  25.69 
 
 
181 aa  41.6  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  31.91 
 
 
451 aa  41.2  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2917  hypothetical protein  26.61 
 
 
150 aa  40.8  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  27.41 
 
 
145 aa  40.4  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4591  hypothetical protein  35.71 
 
 
139 aa  40.4  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>