103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3326 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  306  5e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  64.29 
 
 		 153 aa  186  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1963  hypothetical protein  53.68 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.739506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2009  hypothetical protein  53.68 
 
 		 141 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.456841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1943  hypothetical protein  53.68 
 
 		 136 aa  154  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0278614  normal  0.939013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2185  hypothetical protein  52.21 
 
 		 152 aa  148  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0461451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  52.21 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  48.59 
 
 		 150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4178  hypothetical protein  48.55 
 
 		 141 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6973  hypothetical protein  43.97 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  37.24 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1557  hypothetical protein  41.18 
 
 		 137 aa  113  6.9999999999999995e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3220  hypothetical protein  43.07 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  42.66 
 
 		 146 aa  103  8e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  40.3 
 
 		 140 aa  100  7e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  40.3 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  40.3 
 
 		 140 aa  100  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  37.41 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  37.68 
 
 		 143 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  33.57 
 
 		 160 aa  85.5  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  38.4 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2209  hypothetical protein  33.33 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  37.6 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  37.6 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  36.72 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  32.62 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  38.21 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  36.5 
 
 		 157 aa  72.4  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0753  hypothetical protein  32.7 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1431  hypothetical protein  26.24 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00752075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  30 
 
 		 144 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  35.97 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.267305  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  33.33 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2288  NmrA family protein  29.79 
 
 		 450 aa  58.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1484  hypothetical protein  31.72 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5864  hypothetical protein  33.58 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2333 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3685  hypothetical protein  30.83 
 
 		 179 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3538  hypothetical protein  34.4 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  28.89 
 
 		 163 aa  53.9  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  31.71 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0863  hypothetical protein  32.86 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1550  hypothetical protein  30.53 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0326  hypothetical protein  29.79 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000907903  normal  0.166315 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  30.77 
 
 		 154 aa  51.6  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3634  hypothetical protein  29.84 
 
 		 166 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  31.34 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0499  hypothetical protein  28.97 
 
 		 180 aa  49.7  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  27.91 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3535  hypothetical protein  23.91 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2107  hypothetical protein  31.76 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.118584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3701  hypothetical protein  29.17 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.713261  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  29.6 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  32.28 
 
 		 145 aa  47  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2736  aromatic ring hydroxylating dioxygenase beta subunit  25.78 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37373  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  27.13 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3330  hypothetical protein  27.41 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.662137  hitchhiker  0.00232953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5694  hypothetical protein  22.56 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.614955 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2758  hypothetical protein  23.08 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.232937 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4910  hypothetical protein  31.3 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1516  hypothetical protein  27.14 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0195085  normal  0.450292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  24.64 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0518  hypothetical protein  27.59 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2721  hypothetical protein  30.4 
 
 		 134 aa  45.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7088  hypothetical protein  27.03 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0663  hypothetical protein  28.57 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.344644 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3762  hypothetical protein  33.85 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.503533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0968  hypothetical protein  31.54 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0459119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1737  hypothetical protein  24.48 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  28.8 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  28.8 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4591  hypothetical protein  29.32 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3750  hypothetical protein  33.85 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.834557  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3823  hypothetical protein  33.85 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.190466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0292  hypothetical protein  29.79 
 
 		 190 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  43.9  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  25.93 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  28 
 
 		 163 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1296  hypothetical protein  33.33 
 
 		 165 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0735417  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3544  hypothetical protein  31.06 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2436  hypothetical protein  31.15 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.774863 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3626  hypothetical protein  28.76 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.448566  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  26.45 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2921  hypothetical protein  29.63 
 
 		 183 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3299  hypothetical protein  28.28 
 
 		 185 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2917  hypothetical protein  27.34 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4431  hypothetical protein  25 
 
 		 183 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.135206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2722  hypothetical protein  31.78 
 
 		 133 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4856  hypothetical protein  31.25 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0599762  normal  0.393424 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2029  hypothetical protein  28.03 
 
 		 163 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1461  hypothetical protein  28.91 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0355  hypothetical protein  28.15 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3720  ethyl tert-butyl ether degradation EthD  29.55 
 
 		 274 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4919  hypothetical protein  26.9 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.263996  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5008  hypothetical protein  26.9 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.440663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5301  hypothetical protein  26.9 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.31558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3686  hypothetical protein  25.85 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0535  hypothetical protein  26.21 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7153  hypothetical protein  25 
 
 		 168 aa  40.8  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0228295  decreased coverage  0.00640549 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1268  hypothetical protein  25.52 
 
 		 184 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0254023 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>