54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0432 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_0432  hypothetical protein  100 
 
 
159 aa  333  5.999999999999999e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0309  hypothetical protein  91.45 
 
 
152 aa  296  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.130933 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0386  hypothetical protein  75.32 
 
 
168 aa  257  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.184767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0398  hypothetical protein  75.66 
 
 
152 aa  247  4e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0407  hypothetical protein  75.66 
 
 
152 aa  247  4e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.934587 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10315  hypothetical protein  70.47 
 
 
163 aa  229  1e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.793118 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4383  putative bile acid 7-alpha dehydratase  66 
 
 
154 aa  201  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0302  hypothetical protein  52.55 
 
 
163 aa  146  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.029098  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2755  hypothetical protein  48.91 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000629849  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1506  hypothetical protein  35.33 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.640405  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3322  hypothetical protein  32.92 
 
 
179 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0579422  hitchhiker  0.000746889 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3745  hypothetical protein  32.69 
 
 
187 aa  80.1  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.875835  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5153  hypothetical protein  38.98 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5534  hypothetical protein  38.98 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.940856 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5242  hypothetical protein  38.98 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.766001  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3368  hypothetical protein  33.09 
 
 
157 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.522403  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0033  hypothetical protein  37.9 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.97728  normal  0.143375 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0043  hypothetical protein  37.1 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0052  hypothetical protein  37.1 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0337638  normal  0.0407808 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2186  hypothetical protein  37.23 
 
 
163 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0503259  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7188  hypothetical protein  32.03 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168742  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3329  hypothetical protein  32.35 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254063  hitchhiker  0.00215501 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4177  hypothetical protein  34.78 
 
 
164 aa  61.2  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4599  hypothetical protein  28.93 
 
 
143 aa  60.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4267  hypothetical protein  35.83 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.456235 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2379  hypothetical protein  34.13 
 
 
137 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.748484  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2092  hypothetical protein  28.67 
 
 
160 aa  58.2  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.134179 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1988  hypothetical protein  29.84 
 
 
140 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.550562  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2225  hypothetical protein  32.03 
 
 
142 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.882088  normal  0.159368 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3815  hypothetical protein  27.27 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2053  hypothetical protein  29.84 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2007  hypothetical protein  29.84 
 
 
140 aa  57  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.30425  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0517  hypothetical protein  29.41 
 
 
177 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3201  hypothetical protein  23.7 
 
 
156 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3293  hypothetical protein  31.39 
 
 
156 aa  52.4  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3839  hypothetical protein  29.52 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3326  hypothetical protein  27.91 
 
 
146 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0846911  hitchhiker  0.00213956 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12924  hypothetical protein  28.47 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.935917  normal  0.85717 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7150  hypothetical protein  32.74 
 
 
148 aa  47.4  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.12412  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1507  hypothetical protein  28.35 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.265161  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3285  hypothetical protein  27.61 
 
 
150 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.605935  normal  0.182498 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4120  hypothetical protein  28.69 
 
 
143 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4369  hypothetical protein  27.91 
 
 
146 aa  44.3  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1978  hypothetical protein  29.27 
 
 
156 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.335296  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3714  hypothetical protein  27.27 
 
 
153 aa  44.3  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00025325  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3278  hypothetical protein  29.46 
 
 
141 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.208875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0339  hypothetical protein  28.06 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.201274  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7613  hypothetical protein  29.13 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3527  hypothetical protein  26.35 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257277  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3809  hypothetical protein  25.78 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0361  hypothetical protein  23.39 
 
 
163 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.907929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5490  hypothetical protein  27.61 
 
 
150 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.974909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4109  hypothetical protein  30.16 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2029  hypothetical protein  30.23 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>